Contratação de empresa especializada para prestação de serviço de sequenciamento de DNA de amostras de fungo patogênico, para a Embrapa Trigo, localizada em Passo Fundo/RS.

A contratação do serviço de sequenciamento está prevista em projeto aprovado pela Embrapa. Considerando as limitações técnicas e operacionais do sequenciamento convencional pelo método de Sanger para análises em larga escala, especialmente quanto à capacidade de processamento, abrangência genômica e custo por informação gerada, a contratação de serviço especializado de sequenciamento de genoma completo (Whole Genome Sequencing – WGS) por tecnologia de segunda geração (Next Generation Sequencing – NGS) apresenta-se como a alternativa mais adequada para atender aos objetivos científicos do projeto. A utilização da plataforma Illumina NovaSeq 6000 possibilitará a geração de dados genômicos de alta qualidade, com elevada cobertura e profundidade de sequenciamento, permitindo a caracterização abrangente do genoma dos isolados de Pyricularia oryzae Triticum e a identificação precisa de variantes genéticas potencialmente associadas às diferenças de sensibilidade aos fungicidas avaliados. Além de proporcionar maior eficiência analítica, robustez estatística e confiabilidade dos resultados, o sequenciamento de genoma completo permite a investigação simultânea de múltiplos genes, regiões regulatórias e demais elementos genômicos de interesse, superando as limitações inerentes às abordagens direcionadas. Essa estratégia amplia significativamente o potencial de descoberta de mecanismos moleculares envolvidos na adaptação do patógeno e na evolução da resistência a fungicidas. Sob o aspecto econômico, a tecnologia NGS apresenta melhor relação custo-benefício quando comparada ao sequenciamento tradicional para geração de grandes volumes de dados genéticos, possibilitando maior produtividade científica e otimização dos recursos investidos. Dessa forma, a contratação do serviço de sequenciamento de genoma completo mostra-se tecnicamente necessária e plenamente justificada para o alcance dos resultados previstos no projeto de pesquisa fornecendo uma base sólida para estudos genômicos avançados e para a geração de conhecimento.